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Gianluca Pegolo cresce calcisticamente nell'Hellas Verona. Entra nel giro della prima squadra fin dalla stagione 1998/99. Vi rimane anche nell'annata successiva, senza tuttavia mai scendere in campo. In questi anni è titolare della Primavera.
Nella stagione 2000/01 viene mandato in prestito al Fiorenzuola, in Serie C2 e con la formazione emiliana scende in campo 34 volte.
L'anno successivo torna al Verona, come riserva del portiere titolare Fabrizio Ferron. Ha l'opportunità di fare il suo debutto in Serie A il 25 novembre 2001 in Torino-Verona 5-1 ma, subentrato negli ultimi 20 minuti, subisce tutti e 5 i goal dei padroni di casa. Si riscatta nella partita successiva, vinta 1-0 contro il Brescia, parando un rigore. Conclude la stagione con 2 presenze complessive in campionato. Il 20 agosto 2002 debutta nella Nazionale under-21, con la quale scenderà in campo in altre 2 occasioni.
La stagione 2002/03, con l'Hellas Verona appena tornato in Serie B, segna la sua consacrazione. La formazione gialloblù punta su di lui come portiere titolare. Dimostra subito ottime qualità, che lo porteranno con gli anni a diventare uno dei giocatori più importanti della squadra e ad essere al centro degli interessi di numerosi altri club, anche di categoria superiore. Nel suo primo anno da titolare in B gioca 37 partite, l'anno successivo (2003/04) 31. Nelle stagioni 2004/05 e 2005/06, ha raccolto rispettivamente 37 e 39 gettoni di presenza.
Dopo la retrocessione della formazione scaligera in Serie C, nel calciomercato estivo 2007 lascia Verona per accasarsi al Mantova (in prestito, con diritto di riscatto della comproprietà dal Genoa). Torna nell'estate del 2008 in Liguria, ma viene girato in prestito al Parma, appena retrocesso in Serie B. Con la squadra gialloblù debutta contro il Grosseto, sostituendo Nicola Pavarini, infortunato. Gioca anche la partita successiva contro il Frosinone, terminata 2-2
Fonte : Wikipedia